Le programme Comenius permet aux élèves de plus de 14 ans de partir dans un établissement européen, pour une durée de trois à dix mois. Avant leur départ, les jeunes participent à une journée de formation animée par les Ceméa. Elle vise à leur fournir des premières réponses « pratiques mais aussi psychologiques ». À cette occasion, un guide de préparation au voyage leur est remis.
En 2010-2011, les élèves concernés étaient âgés de 16 ans et leur séjour a duré trois mois en moyenne. En France, 31 établissements ont participé au programme dont 75 % en lycée d’enseignement général, 18 % en collège et 7 % en lycée professionnel.